根据一项研究发现，饮食中含有豆类、面包、鱼、坚果及红酒的人，很可能含有较高水平的健康肠道细菌，反映这些人会更加健康。
荷兰Groningen大学医学中心的研究人员，一共研究了4类人，分别为没有患病的人士、患有克罗恩氏病（Crohn’s）、患溃疡结肠炎（ulcerative colitis）及患过敏性肠综合症（irritable bowel syndrome）的患者，以分析4类人的饮食模式与肠道菌之间的关系。
研究报告共同撰写人兼营养学家Laura Bolte，及其研究小组透过研究确定了61种与微生物种群有关的食物，以及食物类型与微生物种类之间的49种关系。
研究证明，特定饮食可能是治疗或管理肠道疾病的有效方法。
Bolte表示，研究结果反映，透过调节肠道微生物，饮食很可能会成为治疗肠道疾病的重要方式；她表示，植物性食品及地中海风味的饮食，可以协助具有抗炎特性的细菌增长。
Bolte表示，饮食的特点，是进食坚果、水果、蔬菜及豆类的摄入量，高于动物蛋白，并适量食用动物源性食品，例如鱼、瘦肉、家禽、发酵低脂乳制品及红酒。
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