辣条味道虽好，但关于其安全问题，也成了不少人争议的话题。在辣条国家标准征求意见出台之前以及早前一些媒体报道中，辣条可是常常上了食药监局的“黑名单”。比如在2015年至2017年中旬，全国有15个省份共计131家辣条生产企业的195批次辣条上了黑名单，而在在通报的180起食品安全问题中，食品添加剂不合格是主要原因，其中菌落总数超标占68起，甜蜜素超标占30起。
此外，相关人士也曾指出辣条由于产品品类时间短、标准建设滞后，因此还存在着标准衔接不上的问题。
对于辣条产业所相关的种种问题，原国家食品药品监管总局于2016年11月提出调味面制品行业国家标准立项，由河南省口岸食品检验检测所、中国食品科学技术学会等机构牵头，计划用一年左右时间制定好辣条的国家标准。
针对辣条各地标准不一的情况，新近出台的《征求意见稿》中标明，食品添加剂的使用应符合GB 2760中方便米面制品的规定。
